乳房温存療法を行なった場合、心配なのは癌の取り残しや、 切除した場所以外にも画像診断では見つからなかった癌細胞が潜んでいることです。 それらが再発や転移の原因となるからです。手術後の切除した癌組織を顕微鏡で調べると、 温存療法を受けた患者さんの20 - 30％に癌細胞が残っていることが明らかになっています。
そこで、温存療法を行なった場合、残した乳房に放射線をあてることで、 乳房局所の再発率が2 - 3％程度に抑えられます。 一方、全身に転移しているかもしれない乳癌細胞を殺したり、 増殖しないように抑える全身療法が必要です。この全身療法は薬物療法により行なわれます。

薬物療法には、化学療法（抗癌剤）と内分泌療法（女性ホルモンを抑制する療法）があり、 最近ではこれらに加えて分子標的療法が行なわれるようになりました。この３者を組み合わせて術後の治療を行いますが、どのような治療法を選択するかは、個々の患者さんで異なります。
通常は、リンパ節転移の有無、ホルモン感受性の有無、組織学的悪性度、HER-2蛋白発現、年齢などを組み合わせたリスク分類に基づいて行なうのが一般的です。

当院では、経験と治療成績に基づいて、独自の術後療法を行なっており、特に臨床病期がstage 1と2Aの患者さんには副作用の少ない療法を行なっております。 リスク分類による治療ガイドラインにはいろいろありますが、よく用いられる St.Gallan expert consensus meetingの推奨指針をわかりやすいように日本語になおして表に まとめましたので、参考にしてください。

前述のように、温存手術後の乳房照射は温存乳房内の局所再発を予防するために原則として行なうべきで、 局所再発率が約1/3（1/2-1/5）に低下します。
一般的には、乳房に手術のダメージが残っている術直後は避け、３-６か月以内に行なわれます。当院では、通常、術後1-2ヶ月から開始しています。
乳房温存後に行なう放射線療法は、乳房に照射するため、全身への影響はあまりありません。 ですから、脱毛もありませんし、食欲が低下することもほとんどありません。しかし、体型や癌の位置によっては、肺の一部に放射線があたるため、 放射線肺炎を起こすことがまれにあります（1-2％の頻度といわれています）。 また、皮膚の弱い人では、海水浴の後のように皮膚炎がおこる人もありますが、通常１か月くらいでなおります。

乳房切除をした場合でも、リンパ節転移が４個以上ある場合、胸壁照射をすることで再発率が低下します。

術後に薬物療法、特に化学療法と放射線照射のどちらを先行させるのかまた同時に行なう方がよいのかについての結論は出ていません。 しかし、リンパ節転移がある場合のように、潜在的にどこかに遠隔転移が存在すると考えられるような場合には、 化学療法を先行させるべきとの考え方があります。

また、局所再発、リンパ節再発、骨転移に対しても放射線照射は、 局所制御、疼痛管理の点で有用ですが、生存率を向上させる効果はないとされています。

前述のように転移・再発予防のための全身療法は薬物療法により行なわれ、薬物療法には、化学療法（抗癌剤）、内分泌療法（女性ホルモンを抑制する療法）、分子標的療法があり、これら３者を組み合わせて治療を行います。

　　

乳癌は化学療法が比較的奏効する癌です。

現在主として使用されている薬剤は、

注射薬としては、
アントラサイクリン系のドキソルビシン（アドリアシン）とエピルビシン（ファルモルビシン）、
タキサン系のパクリタキセル (タキソール)、ドセタキセル (タキソテール)、およびアブラキサン、
アルキル化剤のシクロホスファミド（エンドキサン）、マイトマイシン、
ビンカアルカロイド系のビノレルビン (ナベルビン)、
そして代謝拮抗剤では、5-FU(５-フルオロウラシル)やゲムシタビン（ジェムザール）などが用いられます。
平成23年4月より、エリブリン（ハラヴェン）が新たに保険適用となりました。

経口薬（飲み薬）としては、
UFT（ユーエフティー）、デオキシフルオロウリジン（フルツロン）、シクロフォスファミド（エンドキサンP）、カペシタビン（ゼローダ）、TS-1（ティーエスワン）などの薬剤があります。
これらの薬剤の単独投与や併用療法など、患者さんの進行度に合わせて様々な組み合わせを用いて治療します。

化学療法、特に注射薬には、脱毛、全身倦怠感、末梢神経障害などに加えて、骨髄抑制や肝障害などの、時として致命的になるような副作用があります。
一方、経口薬も、手足症候群、下痢、末梢神経障害などの副作用がみられます。
いずれにしても、定期的に血液検査を行ないながら、注意深く治療を行う必要があります。

乳癌の60-70％が、女性ホルモンの影響を受けて増殖します。 そのため、女性ホルモンの作用を抑えたり、女性ホルモンの分泌を抑制すれば、 乳癌の増殖を抑えることができます。このような治療法が内分泌療法です。

この内分泌療法は女性ホルモンの影響を受ける乳癌、 すなわち女性ホルモンの受容体がある場合に有効ですので、女性ホルモン受容体があるかを調べることが大切です。
基本的には２種類の女性ホルモン、エストロジェンとプロジェストロンの受容体について検査を行ないます。

内分泌療法の基本薬剤は、タモキシフェン（ノルバデックス）というエストロジェンとその受容体の作用を抑制する薬です。 タモキシフェンは閉経前と閉経後の両者に用いられ、術後補助療法としては早期症例やリンパ節転移(-)例には5年間、リンパ節転移(+)などのhigh risk例には５年以後も継続投与することが有用であるとされています。同じ系統の薬剤としては、トレミフェン（フェアストン）がありますが、術後の補助療法としてよりも、転移・再発症例に使用する事が多い薬剤です。

これに対し近年は、閉経前のホルモン受容体(+)の早期症例には、 脳下垂体に作用して卵巣からの女性ホルモンの分泌を抑制するLH-RHアナログという薬のゴセレリン（ゾラデックス）やリュープロレリン（リュープリン）の 投与が推奨されています。

さらに、閉経後のホルモン受容体(+)の早期症例には、 タモキシフェンよりもアロマターゼ阻害剤という副腎から分泌される男性ホルモンを女性ホルモンに変えるアロマターゼという酵素を阻害する アナストロゾール（アリミデックス）、エキセメスタン（アロマシン）、レトロゾール（フェマーラ）の方が推奨されています。
また、タモキシフェンを２-5年投与し、その後はアロマターゼ阻害剤を投与する交代療法も推奨されています。

内分泌療法は化学療法に比べて、致命的な副作用はないのですが、女性ホルモンを抑制するため、 更年期症状とよく似た症状が出ます。
ほてり、のぼせ、いらいら、発汗、震え、体温調節がうまく行かず暑さや寒さに敏感になり、抑鬱症状や、不安神経症のような症状が出ることもあります。 また、関節痛が出る人もあります。

さらに、しみ・そばかすが増えたり、膣乾燥症や掻痒症に悩む人もいますし、高齢者では骨粗鬆症も問題となります。

現在、乳癌に対する分子標的療法として保険適応があるのはトラスツズマブ（ハーセプチン）とラパチニブ（タイケルブ）です。 いずれもHER-2というタンパク質が強陽性の乳癌に投与されます。
ハーセプチンは、日本では従来は進行再発例に限って投与していましたが、 現在は術後補助療法の１つとしてHER-2強陽性のHigh risk例にも投与されるようになってきました。タイケルブは、現在のところ、手術不能または再発例に対して保険適用が認められています。
重要な副作用としては、トラスツズマブは心毒性、タイケルブは下痢や皮膚障害などがあげられます。
　H23年度より、VEGF（血管内皮細胞増殖因子）に対する阻害剤であるベバシズマブ（アバスチン）が、再発・手術不能乳癌に対して保険適用となりました。しかし、以前に治療を受けたことのある二次治療（セカンドライン）以降の患者さんでは効果が少ないとされています。